O Instituto do Câncer do Ceará foi fundado em 25 de novembro de 1944, como entidade filantrópica sem fins lucrativos. Ao longo de mais de cinco décadas sempre esteve voltado para o atendimento de pessoas carentes, portadoras de câncer. Na sua condição de entidade filantrópica, propicia atendimento a cerca de 90% dos casos pelo Sistema Único de Saúde (SUS).
O início dos atendimentos a pacientes em situação de pobreza deu-se ainda em 1944, com o tratamento de radioterapia. A partir de 1979 a entidade iniciou os serviços de Prevenção do Câncer e em 1988 acrescentou a quimioterapia. A maior dificuldade ao longo desses anos residia no encaminhamento dos doentes necessitados de cirurgia, face a restrita disponibilização de leitos nos hospitais de Fortaleza para atender casos de pacientes sem recursos, com histórico de câncer e com indicação de cirurgia, quadro que demandava custos maiores em vista do tempo de permanência no hospital.

Esse quadro de dificuldades ensejou por parte da entidade o projeto do seu hospital, que só tomou corpo em 1995, quando a direção do Instituto do Câncer do Ceará decidiu dar início à construção de um prédio de 5 andares, no mesmo local onde já funcionavam os seus serviços de Radioterapia, Prevenção e Quimioterapia. Três anos após, em 1999, estava concluída a parte física do empreendimento, construída dentro dos mais modernos padrões de engenharia. A etapa seguinte foi de aquisição de equipamentos, montagem dos serviços e de preparação para o início de funcionamento do complexo hospitalar. Em abril de 1999, foi realizada a primeira cirurgia. A inauguração oficial deu-se em novembro de 1999, com a presença do então Ministro da Saúde José Serra.
O advento do Hospital do Câncer, propiciou ao Instituto do Câncer do Ceará uma nova dimensão no atendimento aos pacientes e na sua atuação na área de saúde. A realização desse projeto antigo, de décadas, permite agora que, em seu próprio espaço, possa realizar até seis cirurgias simultaneamente, disponibilizando 140 leitos para atendimento aos doentes de câncer, abrangendo majoritariamente pacientes do SUS, e também, pacientes de convênio e particulares.
O paciente também poderá, no âmbito do Hospital, realizar praticamente todos os exames diagnósticos da doença, através de serviços de imagem, laboratoriais e de tratamento - Radioterapia, Braquiterapia, Quimioterapia, Iodoterapia e Hormonioterapia, que ganharam uma roupagem nova, dentro de um processo de modernização.

Novamente o Instituto do Câncer do Ceará planeja um novo investimento que viria complementar a atuação do Hospital, otimizando sua capacidade de atendimento através de um novo prédio de seis pavimentos anexo ao hospital e cuja utilização seria voltada principalmente para as áreas de consulta e diagnóstico, além de racionalizar a utilização dos espaços do hospital, gerando um incremento no número de internamentos de cerca de 40% em vários tipos de serviços.
Por fim, a instituição se configura hoje na comunidade médica como unidade hospitalar de referência no tratamento de câncer, em função de sua estrutura física, dos equipamentos atualizados tecnologicamente, da qualificação dos seus profissionais, especialmente seu corpo médico e de enfermagem e de um componente histórico no trato com seus pacientes, que é a humanização que imprime em todas as suas atividades.